1 ... 11 12 13 14 15 16 17 18 ... 74

The platon crystallographic package - səhifə 15

səhifə15/74
tarix04.12.2017
ölçüsü5.01 Kb.

:

afs
afs -> Meningoensefalit, meningoensefalit
afs -> Nb deze bovenstaande tekst wel weghalen!
afs -> Allergen Checklist for Food Suppliers or Manufacturers

================================================================================
Molecular Symmetry see: T. Pilati & A. Forni, J.Appl.Cryst. (1998), 31, 503-504
For CSM, see: H. Zabrodsky et al. (1993) JACS, 115, 8278-8298
================================================================================
Resd #         Inertial  Moments    Degree Symbol    CSM           RMS    Tol
--------------------------------------------------------------------------------
    1      116.      116.      115.    3   Oh       0.0105        0.0102 0.10
 Symmetry element     CSM and Max.Diff.  Symmetry element     CSM and Max.Diff. 
  1 [E  ] x,y,z           0.0000 0.0000   2 [C3 ] y,z,x           0.0042 0.0080 
  3 [C2 ] -x,-y,z         0.0063 0.0086   4 [C4 ] x,z,-y          0.0105 0.0144 
  5 [C2 ] x,-y,-z         0.0084 0.0130   6 [C2 ] -x,y,-z         0.0063 0.0086 
  7 [Cs ] x,y,-z          0.0063 0.0086   8 [Ci ] -x,-y,-z        0.0000 0.0000 
  9 [C3 ] z,x,y           0.0042 0.0080  10 [C3 ] -y,z,-x         0.0098 0.0125 
 11 [C2 ] z,-y,x          0.0073 0.0106  12 [C3 ] -y,-z,x         0.0070 0.0121 
 13 [C3 ] y,-z,-x         0.0070 0.0121  14 [S6 ] y,-z,x          0.0098 0.0125 
 15 [S6 ] -y,-z,-x        0.0042 0.0080  16 [C3 ] z,-x,-y         0.0070 0.0121 
 17 [C4 ] -y,x,z          0.0084 0.0129  18 [C3 ] -z,x,-y         0.0070 0.0121 
 19 [C3 ] -z,-x,y         0.0098 0.0125  20 [S6 ] -z,x,y          0.0070 0.0121 
 21 [S6 ] -z,-x,-y        0.0042 0.0080  22 [C2 ] -x,-z,-y        0.0000 0.0000 
 23 [C2 ] -z,-y,-x        0.0031 0.0069  24 [C2 ] -y,-x,-z        0.0031 0.0069 
 25 [C4 ] -z,y,x          0.0084 0.0129  26 [C2 ] y,x,-z          0.0073 0.0106 
 27 [C4 ] x,-z,y          0.0105 0.0144  28 [S6 ] -y,z,x          0.0070 0.0121 
 29 [S6 ] z,x,-y          0.0098 0.0125  30 [Cs ] x,-y,z          0.0063 0.0086 
 31 [S6 ] y,z,-x          0.0070 0.0121  32 [S6 ] z,-x,y          0.0070 0.0121 
 33 [Cs ] -x,y,z          0.0084 0.0130  34 [C4 ] y,-x,z          0.0084 0.0129 
 35 [C2 ] -x,z,y          0.0084 0.0130  36 [C4 ] z,y,-x          0.0084 0.0129 
 37 [Cs ] x,-z,-y         0.0084 0.0130  38 [S4 ] -z,-y,x         0.0084 0.0129 
 39 [S4 ] -y,x,-z         0.0084 0.0129  40 [S4 ] -x,z,-y         0.0105 0.0144 
 41 [S4 ] z,-y,-x         0.0084 0.0129  42 [Cs ] -y,-x,z         0.0073 0.0106 
 43 [Cs ] z,y,x           0.0031 0.0069  44 [Cs ] y,x,z           0.0031 0.0069 
 45 [Cs ] x,z,y           0.0000 0.0000  46 [S4 ] y,-x,-z         0.0084 0.0129 
 47 [S4 ] -x,-z,y         0.0105 0.0144  48 [Cs ] -z,y,-x         0.0073 0.0106 

2. Inter-molecular


This (experimental) routine attempts to identify symmetry relations between 
crystallographically independent molecules. 
In general there will be three outcomes of a NONSYM analysis: 
- A symmetry direction is found compatible with the translation lattice. In such a 
case, ADDSYM should have indicated what the read space group will be. 
- A symmetry direction is found that is not compatible with the translation lattice, 
i.e with a non-zero angle with all translation vectors in the lattice, and thus only 
local.
A possible consequence could be disorder/twinning. 
- No satisfactory local or global (pseudo) symmetry direction. 

Instructions


The NONSYM feature is invoked either with a left-button-click on NONSYM or from the 
keyboard: 

CALC NONSYM

  

1.3.4.8 – LEPAGE – Report Higher Lattice Symmetry with the LePage Tool 


The LEPAGE option in PLATON checks for possible higher metrical symmetry of the 

lattice. It is based on the excellent algorithm published by LePage (1982), but coded 
independently from scratch (Spek, 1988). 
Keyboard I
nstruction options: 

LEPAGE (mang[0.3]) (MaxDot[2]) (TwoAxCrit[0.5])

 

mang

 is an optional parameter setting an alternative angular maximum deviation from 
metrical symmetry [default 0.3 degree]. 

MaxDot

 values greater than 2 may indicate non-merohedral twinning. The maximum value 
is 6. 

TwoAxCrit

 is a parameter determining whether a lattice vector 'coincides' with a reciprocal 
lattice vector [default 0.5 Degree]. 
What is needed to run PLATON/LEPAGE is a small file ('x.spf') with the following 
data/instructions 

TITL text 


CELL a b c alpha beta gamma 


SPGR space group name (Can be the Laue equivalent) 


LEPAGE 


and run with the instruction: 

platon x.spf

 
Note: The Space group information is used only to pick-up the current lattice centering type. 
The alternative LATTICE instruction (i.e. LATT C for Space group C2/c) would be 
sufficient. 

Example of 'x.spf' (triclinic to cubic I)


TITL look for metrical symmetry


CELL 10 10 10 109.5 109.5 109.5


LATT P


LEPAGE 


Alternatively, provide a RES, CIF, CSD or SPF structured dataset to PLATON and invoke 
LEPAGE by clicking on the LEPAGE button in the PLATON opening menu or with the 
instruction LEPAGE from the keyboard interface. 
 

1.3.4.9 – DELRED – Report Higher Lattice Symmetry with the DELRED Tool 


Delaunay Cell reduction and search for higher (pseudo) lattice symmetry. 
See: Zimmermann & Burzlaff (1985) and  Burzlaff & Zimmermann, (1985)

General Instruction: KDELRED (p1 [0.5] (p2 [1.0]))

 

p1

 in a tolerance on lengths

p2

 is a tolerance on angles
Data required on file x.spf: 

TITL text 


CELL a b c alpha beta gamma 


SPGR space group name (Can be the Laue equivalent) 


DELRED (p1 (p2)) 




Dostları ilə paylaş:

©2018 Учебные документы
Рады что Вы стали частью нашего образовательного сообщества.
?


the-scientific-and-53.html

the-scientific-and-58.html

the-scientific-and-62.html

the-scientific-and-67.html

the-scientific-and-71.html